Biomarcadores moleculares del género salmonella aislada en alimentos

Introducción: El género Salmonella está conformado por patógenos alimentarios causantes de salmonelosis, una enfermedad de distribución cosmopolita, que afecta a todos los grupos poblacionales, tanto en los países desarrollados como en los que están en vía de desarrollo, siendo un problema de salud pública. Con relación a esto, los biomarcadores moleculares se convierten en una herramienta útil para su diagnóstico y seguimiento. Objetivo: Describir los marcadores moleculares del género Salmonella y las diferentes técnicas moleculares empleadas para su detección en la actualidad. Metodología: Se realizó una búsqueda bibliográfica en las bases de datos Science direct, PubMed, Proquest y Ovid, utilizando 5 palabras clave, las cuales se combinaron de diferentes maneras para finalmente obtener 50 referencias bibliográficas. Resultados: Se evidencia gran variedad de biomarcadores del género Salmonella, los cuales son detectados por pruebas moleculares, como la técnica de PCR, que permite la detección directa de genes que codifican para los antígenos somáticos O y flagelares H de Salmonella y la determinación de los posibles serovares implicados en las enfermedades transmitidas por alimentos, de una manera rápida y precisa. Cabe resaltar las ventajas de los métodos moleculares frente a la serotipificación en cuanto al costo-beneficio, estandarización óptima, alta sensibilidad, especificidad y rapidez en la obtención de los resultados. Conclusiones: Los biomarcadores moleculares se consideran una herramienta de referencia para la identificación de serovares de Salmonella y su serotipificación, a través de la PCR, con un alto nivel de especificidad y sensibilidad en los resultados, aportando información relevante a nivel epidemiológico.

Introduction: The Salmonella genus is composed of food pathogens that cause salmonellosis, a disease of cosmopolitan distribution that affects all population groups, both in developed and developing countries, being a public health problem. In this regard, molecular biomarkers become a useful tool for its diagnosis and monitoring. Objective: Describe which are the molecular markers of the Salmonella genus and their determination through different molecular techniques currently used. Methodology: A bibliographic search was performed in databases such as Pubmed, Science direct, Elsevier, NCBI, Proquest and Ovid, using 5 keywords, which were combined in different ways to finally obtain 50 bibliographic references from the year 2005 to currently, selecting articles in English and Spanish. Results: A great variety of biomarkers of the Salmonella genus are evident, which are detected by molecular tests such as the PCR technique, this allows the direct detection of the genes that encode the somatic O and flagellar H antigens of Salmonella and quickly allows the determination of the possible serovars involved in food-borne diseases, in a fast and precise way, in addition to highlighting the advantages of the described molecular methods compared to serotyping in terms of cost-benefit, optimal standardization, high sensitivity, specificity and speed in the results. Conclusions: Molecular biomarkers are considered a reference tool for the identification of Salmonella serovars and their serotyping, through molecular techniques such as PCR, with a high level of specificity and sensitivity in the results, which are of epidemiological importance.

ß-l; -lactamasas AmpC en bacilos gramnegativos de aislados clínicos en un centro hospitalario de tercer nivel en Colombia / AmpCß-l;-lactamases in Gram-negative bacilli from clinical isolates in a Colombian tertiary hospital

Introdución: Las ß-lactamasas AmpC son enzimas con capacidad hidrolítica, pueden ser de tipo constitutivo o inducible. No existe un método estandarizado para su determinación fenotípica por normas internacionales; la detección de estas mediante el uso de la biología molecular podría ser una alternativa útil para vigilancia y control de la diseminación de clones circulantes en el entorno hospitalario. Objetivo: Determinar el fenotipo de resistencia y genes expresados en la producción de ß-lactamasas AmpC en bacilos gramnegativos de aislados clínicos en un centro hospitalario. Métodos: Estudio observacional, descriptivo y de corte transversal. Se seleccionaron 78 cepas bacterianas como portadoras de ß- lactamasas AmpC. Se les realizó prueba de aproximación de disco; a las cepas con resultado positivo se seleccionaron para extracción de ADN y PCR multiplex para detección de 6 familias genes AmpC. Se determinó la frecuencia por tipo de muestra, servicio y comparación con el perfil de susceptibilidad. Resultados: De las cepas seleccionadas con fenotipo AmpC, el 57,6 por ciento (45/78) se consideró caso confirmado ß-lactamasas AmpC por su positividad para la prueba confirmatoria. La técnica molecular utilizada confirmó en el 40 por ciento (18/45) la presencia de genes AmpC. Se obtuvo con mayor frecuencia el gen MIR n= 9 (20 por ciento), seguido de DHA n= 7 (15 por ciento). Conclusiones: La detección oportuna de genes que codifican para ß-lactamasas AmpC permite establecer estrategias para evitar la circulación mediada por plásmidos en hospitales, así como utilizar mejores opciones terapéuticas que no induzcan a otros mecanismos de resistencia(AU)

Introduction: AmpC ß--lactamases are enzymes with hydrolytic activity. They may be either constitutive or inducible. No standardized method is available for their phenotypical determination by international standards. Their detection by molecular biology could be a useful alternative for the surveillance and control of the spread of clones circulating in hospital environments. Objective: Determine the resistance phenotype and genes expressed in the production of AmpC ß-lactamases in Gram-negative bacilli from clinical isolates in a hospital. Methods: An observational descriptive cross-sectional study was conducted. A total 78 bacterial strains were selected as carriers of AmpC ß-lactamases. Disc approximation tests were performed. The strains testing positive were selected for DNA extraction and multiplex PCR for detection of six AmpC gene families. Determination was made of the frequency per sample type, service and comparison with the susceptibility profile. Results: Of the strains selected with AmpC phenotype, 57.6 percent (45/78) were considered to be AmpC β-lactamase confirmed cases, due to their positive confirmatory test. The molecular technique used confirmed the presence of AmpC genes in 40 percent (18/45) of the cases. The gene most commonly obtained was MIR n= 9 (20 percent), followed by DHA n= 7 (15 percent). Conclusions: Timely detection of genes encoding for AmpC ß-lactamases makes it possible to set up strategies to prevent plasmid-mediated circulation in hospitals, as well as apply better therapeutic options that do not induce other resistance mechanisms(AU)

Perfil de tolerancia al triclosán y detección de los genes MexA, MexC, AcrB y oqxA relacionados con la expresión de bombas de expulsión en aislados clínicos del género Enterobacter aerogenes y Enterobacter cloacae / Triclosan tolerance profile and detection of MexA, MexC, AcrB and oqxA genes related to the expression of expulsion pumps in clinical isolates of Enterobacter aero- genes and Enterobacter cloacae / Perfil de tolerância ao triclosan e detecção dos genes mexA, mexC, acrB e oqxA relacionados à expressão de bombas de expulsão em isolados clínicos do gênero Enterobacter aerogenes e Enterobacter cloacae

Introducción. La resistencia a los antimicrobianos y la tolerancia a biocidas está dada por mecanismos comunes, generados por su uso en diferentes ambientes; mecanismos como la expresión de bombas de expulsión presentes en bacterias del género Enterobacter circulantes amenaza la eficacia de los antimicrobianos limitando las opciones de terapia antibiótica. Objetivos: Determinar el perfil de tolerancia al triclosán y detección de genes asociados a bombas de expulsión en aislados clínicos de Enterobacter aerogenes y Enterobacter cloacae. Materiales y Métodos: Se realizó un estudio observacional, descriptivo y de corte transversal, se determinaron perfiles de tolerancia al triclosán por microdilución, de susceptibilidad antimicrobiana, confirmación fenotípica de mecanismos de resistencia, por reacción en cadena de la polimerasa, se identificó la presencia de genes que codifican para bombas de expulsión. Resultados: El 17% correspondió a Enterobacter cloacae y el 6% Enterobacter aerogenes. El 93,7% de los aislados clínicos del género Enterobacter presentó el fenotipo de resistencia BLEE y AmpC. En el 81,3% de los aislamientos se obtuvo la presencia de al menos un gen relacionado con las expresión de bombas de expulsión, siendo frecuentes MexC y AcrB; no identificó presencia del gen oqxA. Conclusiones: La resistencia a diferentes grupos de antibióticos se identifica en especies de Enterobacter circulante, así la presencia de enzimas BLEE y AmpC, la presencia de genes relacionados con bombas de expulsión y la alta tolerancia al triclosán. Palabras clave: Triclosán, Resistencia, Bombas de expulsión, Genes, Biocida

Introduction. Antimicrobial resistance and tolerance to biocides is given by common mechanisms, generated by the use of antimicrobial and biocidal substances in different environments, these me- chanisms such as the expression of expulsion pumps present in bacteria of the Enterobacter genus circulating threatens the efficacy of antimicrobials by limiting antibiotic therapy options. Objective: to determine the triclosan tolerance profile and detection of genes associated with expul- sion pumps in clinical isolates of Enterobacter aerogenes and Enterobacter cloacae. Materials and Methods: An observational, descriptive and the cross-sectional study was performed, triclosan tolerance profiles were determined by microdilution, antimicrobial susceptibility, phenotypic confirmation of resistance mechanisms, by the presence of polymerase chain reaction, the presence of genes that code for expulsion pumps. Results: The 17% corresponded to Enterobacter cloacae and 6% Enterobacter aerogenes. 93.7% of the clinical isolates of the genus Enterobacter presented the ESBL and AmpC resistance phenotype. In 81.3% of the isolates, the presence of at least one gene related to the expression of ejection pumps was obtained, with MexC and AcrB being frequent; did not identify the presence of the oqxA gene. conclusions: The resistance to different groups of antibiotics is identified in circulating Enterobacter species, as well as the presence of ESBL and AmpC enzymes, the presence of genes related to ejection pumps, and high tolerance to triclosan.

Introdução.A resistência antimicrobiana e a tolerância a biocidas esta dada pelos mecanismos comuns gerados pelo uso em diferentes ambientes; mecanismos como a expressão de bombas de expulsão presentes em bactérias do gênero Enterobacter circulantes ameaza a eficácia das antimicrobiana limitando as opções de terapia antibiótica. Objetivos: Determinar o perfil de tolerância ao triclosan e detecção dos genes asociados a bombas de expulsão em isolados clínicos Enterobacter aerogenes e Enterobacter cloacae. Materiais e Métodos: Realizou-se um estudo observacional, descritivo e de corte transversal, deter- minaram-se perfiles de tolerância ao triclosan por microdiluição, de susceptibilidade antimicrobiana, confirmação de mecanismos de resistência fenotípica por reação em cadeia da polimerase, identifi- cou-se a presença de genes que codificam para bombas de expulsão. Resultados: 17% correspondeu ao Enterobacter cloacae e 6% ao Enterobacter aerogenes. 93,7% em isolados clínicos do gênero Enterobacter presentou o fenótipo de resistência BLEE e AmpC. No 81% dos isolamentos se obteve a presença de pelo menos um gen relacionado à expressão de bombas de expulsão, sindo frequentes mexC e acrB; não se identificou a presença do gen oqxA. Conclusões: A resistência de diferentes grupos de antibióticos se identificou em espécies de Entero- bacter circulante, assim a presença de enzimas BLEE e AmpC, a presença de genes relacionados com bombas de expulsão e a alta tolerância ao triclosan.

Perfiles de susceptibilidad de grupos bacterianos aislados de productos cárnicos en Tunja, Boyacá / Susceptibility profiles of bacterial groups of meat products in Tunja, Boyacá / Perfil de susceptibilidade de grupos bacterianos isolados de produtos à base de carne e derivados em Tunja, Boyacá

Introducción. Las bacterias son organismos que se encuentran en diferentes tipos de ambientes que actúan como reservorios, entre estos, los productos de consumo derivados de los animales. Algunas de estas bacterias son capaces de causar enfermedad a los humanos y, a su vez, han evolucionado generando resistencia a antibióticos, lo cual se ha convertido en un problema de salud pública a nivel mundial. Objetivo. Describir los perfiles de susceptibilidad de grupos bacterianos provenientes de productos cárnicos y derivados, de dos lugares de abasto de Tunja. Materiales y Métodos. Estudio descriptivo de corte transversal. Se realizó muestreo de productos cárnicos en los expendios de carne y derivados, en un periodo de tres meses, en dos lugares de abasto de la ciudad de Tunja, de los cuales se tomaron diferentes cortes de productos cárnicos para su posterior análisis. Resultados. A partir de 160 muestras cárnicas recolectadas de 32 puntos de venta, se aislaron 333 cepas bacterianas, encontrando presencia de bacterias Gram negativas y Gram positivas en un 83.2% y 16.8% respectivamente. Por otra parte, los perfiles de susceptibilidad antimicrobiano para estas bacterias mostraron sensibilidad del 19,2% y 0,9%, respectivamente, a los seis antibióticos utilizados para cada grupo en el estudio. Conclusiones. Se encontró una alta presencia de bacterias procedentes de los aislados de productos cárnicos, que obliga a la mejora de las condiciones de manipulación y expendio de estos productos, dado que, entre los principales riesgos se encuentra la adquisición de cepas resistentes mediante el consumo de alimentos contaminados.

Introduction. Bacteria are found in different types of environments that act as reservoirs, among these consumer products derived from animals. Some of these bacteria are able to cause disease to humans and, it in turn, they have devolved generating antibiotics resistance, for that reason has become a public health problem worldwide. Objective. To describe susceptibility profiles of groups bacterium from meat products and derivatives, in two Tunja´s market. Materials and Methods. Descriptive cross-sectional study, they realized sampling meat´s products in meat sale zone and by-products in a three-month period in two Tunja´s market, which different cuts of meat products were taken, for further analysis. Results. From 160 meat samples collected from 32 outlets were isolated 333 bacterial strains, it found presence of Gram-negative and Gram-positive bacteria in 83.2% and 16.8% respectively. Furthermore, the profiles of antimicrobial susceptibility for these bacteria, it showed sensibility of 19,2% and 0,9% respectively to the six antibiotics used for each group in the study. Conclusions. It found a high presence of isolated bacterium from meat products, what oblige to improve od manipulation conditions and sale of these products, since, among the principal risks are the acquisition of strains resistant by means consume of these food contaminate.

Introdução. As bactérias são microorganismos que se encontram em diferentes ambientes os quais atuam como reservatórios, entre estes, os produtos de consumo derivados de animais. Algumas das bactérias têm a capacidade de causar doenças em humanos, além disso, têm evoluído gerando resistência aos antibióticos, o qual tornou-se um problema de Saúde Pública a nível mundial. Objetivo. Descrever os perfis de susceptibilidade de grupos bacterianos isolados de produtos à base de carne e derivados, de dois locais de suprimento de Tunja. Materiais e métodos. Estudo descritivo e transversal. Realizou-se uma amostragem de produtos à base de carne e derivados por um período de três meses, em locais de suprimento da cidade de Tunja, foram coletadas diferentes secções dos produtos para uma análise posterior. Resultados. De 160 amostras de produtos à base de carne e derivados coletados em 32 pontos de venda, foram isoladas 333 estirpes bacterianas, com a presença de bactérias Gram negativas y Gram positivas em 83.2 % e 16.8 % respetivamente. Por outro lado, os perfis de susceptibilidade aos antimicrobianos mostraram sensibilidade de 19,2 % e 0,9 % respetivamente, aos seis antibióticos usados para cada grupo no estudo. Conclusões. Encontrou-se uma elevada presença de bactérias isoladas de produtos à base de carne e derivados, que obriga a melhorar as condições do manuseio e da despesa dos mesmos, dado que, entre os principais riscos encontra-se a aquisição de estirpes resistentes pelo consumo dos alimentos contaminados.

Uso de biocidas y mecanismos de respuesta bacteriana / Use of biocides and bacterial response mechanisms

La constante aparición de microorganismos que incrementan su tolerancia a sustancias utilizadas para su control como los biocidas está generando atención en salud pública y debe ser estudiado, teniendo en cuenta los diversos riesgos que se pueden enfrentar principalmente en pacientes con alta susceptibilidad a las infecciones asociadas a la atención en salud, dado que estos biocidas son utilizados cotidianamente lo que ha generado mecanismos bacterianos como lo son la formación de biopelículas y aquellos que incrementan su tolerancia como la generación de bombas de flujo. Esta respuesta bacteriana a la presión de los biocidas se potencia por la aparición de microorganismos resistentes a los antimicrobianos de uso en el tratamiento y control de las infecciones lo que hace difícil el control de estos. Se realizó una revisión de literatura disponible en las bases de datos Proquest, ovid, Science direct, PubMed, donde se encontraron un total de 103 artículos y se seleccionaron 73, de acuerdo con el año de publicación en los idiomas español e inglés, que incluyeron estudios descriptivos y de revisión. El objetivo de este artículo fue realizar una revisión acerca de los principales mecanismos de acción de biocidas y la respuesta de tolerancia que presentan los microorganismos frente a estos; lo que conlleva a la reflexión sobre las implicaciones del uso de estas sustancias sobre la salud humana.

The constant appearance of microorganisms that increase their tolerance to substances used for their control such as biocides is generating attention in public health and should be studied, taking into account the various risks that can be faced mainly in patients with high susceptibility to infections associated with health care, given that these biocides are used on a daily basis, which has generated bacterial mechanisms such as the formation of biofilms and those that increase their tolerance, such as the generation of flow pumps. This bacterial response to the pressure of the biocides is enhanced by the appearance of microorganism's resistant to the antimicrobials used in the treatment and control of infections, which makes their control difficult. A literature review was made available in the databases Proquest, ovid, Science direct, PubMed, where a total of 103 articles were found and 73 were selected, according to the year of publication in the Spanish and English languages, which included Descriptive and review studies. The objective of this article is to carry out a review about the main action mechanisms of biocides and the tolerance response presented by microorganisms against them; which leads to reflection on the implications of the use of these substances on human health.

Antibiotic Resistance: Origins, evolution and healthcare-associated infections / Resistencia a antibióticos: Origen, evolución e infecciones asociadas a la atención en salud

Abstract The increased incidences of Healthcare-associated Infections (HAI) caused by multidrug-resistant bacteria, have led to an enlarged number of morbidity and mortality cases. Besides, other factors that are affected are patients, families and institutions providing health services. Therefore, the permanent study of the subject is necessary to identify possible strategies that contribute to the reduction of the issue. A critical review of the literature based on the origin of antibiotics, the evolution of their respective resistance, and the impact on public health from a historical and current perspective was developed. The search of the literature was carried out in the bibliographic databases: Pubmed, Web of Science, Scopus, SciELO, The Cochrane Library and Lilacs. The reviewed literature showed, from the historical viewpoint, the discovery of antibiotics to the last-generation antibiotics. The rapid coevolution of genes for antibiotics resistance and its subsequent spread to hundreds of species of microorganisms by Horizontal Transfer gene (HTG) was also reviewed. It is also discussed how the expansion in antimicrobial resistance (AMR) generates a series of factors that increase health-care associated infections care (HAI) and their impact on public health. The development of antibiotics from the discovery to recent changes in the behavior and response of the microorganisms with the generation of AMR shortly after, is one of the most fantastic examples of the evolution that exists in nature.

Resumen El aumento en la incidencia de infecciones asociadas a la atención en salud causada por microorganismos multiresistentes a antibióticos, han incrementado la morbilidad, mortalidad y otros factores que afectan a paciente, familias e instituciones prestadoras de servicios de salud; por lo que se ha hecho necesario el estudio permanente del tema, para identificar posibles estrategias que contribuyan a disminuir la situación. Se realizó una revisión de la literatura sobre el origen de los antibióticos, la evolución de su respectiva resistencia, el impacto en la salud pública; desde una perspectiva histórica y actual. La búsqueda de la literatura se realizó en las bases de datos bibliográficas: Pubmed, Web of Science, Scopus, SciELO, The Cochrane Library y Lilacs. El análisis de la literatura mostró desde el punto de vista histórico, el descubrimiento de los antibióticos hasta los últimos antibióticos de última generación, y la rápida coevolución de los genes de resistencia a los antibióticos y su posterior diseminación a cientos de especies de microorganismos mediante la Transferencia Horizontal de Genes (THG). También es discutido como el incremento de la resistencia a los antibióticos (RAM) genera una serie de factores que potencian las infecciones asocia de las a los cuidados de la salud (IACS) y su impacto en la salud pública. La historia desde el descubrimiento, los cambios en el comportamiento de uso de los antibióticos y la respuesta de los microorganismos con la generación de la RAM poco tiempo después, es uno de los ejemplos más fantásticos de coevolución que existe en la naturaleza.

Genes de resistencia en bacilos Gram negativos: Impacto en la salud pública en Colombia / Resistance genes in gram negative bacilli: impact on public health in Colombia

Introducción: La resistencia antimicrobiana es un grave problema de salud pública que se encuentra en aumento. Entre los factores más importantes relacionados con la diseminación de bacterias multirresistentes está el uso inapropiado de antibióticos y la aplicación insuficiente de las medidas de prevención y control. Adicionalmente, las bacterias tienen la capacidad de mutar o generar mecanismos de transferencia de genes de resistencia mediante plásmidos, transposones e integrones. Materiales y métodos: Se hizo una revisión crítica de la literatura sobre los principales genes de resistencia Gram negativos y su impacto en la salud pública. Fueron utilizadas las bases de datos de Medline, Embase, Lilacs, ScienceDirect, Scopus, SciELO, the Cochrane Library y Lilacs. Resultados: Se presenta una revisión de literatura que describe y analiza los principales genes de resistencia a antibióticos presentes en bacilos gram negativos, su origen, evolución y diseminación a microorganismos mediante la transferencia horizontal de genes; justificando la importancia de realizar una vigilancia epidemiológica del tránsito de clones con diferentes perfiles de resistencia y principales enzimas. Conclusiones: El seguimiento de la resistencia antimicrobiana desde el punto de vista de la epidemiología molecular forma parte transcendental de la vigilancia antibiótica como lo recomienda la Organización Mundial de la Salud; pues representa el futuro del monitoreo de la resistencia.

Introduction: Antimicrobial resistance is a serious public health problem that is increasing. Among the most important factors related to the spread of multi-resistant bacteria are the inappropriate use of antibiotics and the insufficient implementation of prevention and control measures. Additionally, bacteria have the ability to mutate or create mechanisms for transfer of resistance genes via plasmids, transposons and integrons. Materials and methods: A critical review of the literature on major resistance genes in Gram negative bacteria and its impact on public health was conducted. Data have been collected from Medline, Embase, Lilacs, ScienceDirect, Scopus, SciELO, the Cochrane Library and Lilacs. Results: A review of literature that describes and analyzes the main antibiotic resistance genes present in gram-negative bacilli is presented, as well as their origin, evolution, and subsequent spread to hundreds of species of microorganisms by Horizontal gene transfer which justifies the importance of conducting an epidemiological surveillance on transit of clones with different resistance profiles and major enzymes. Conclusions: The control of antimicrobial resistance from the point of view of molecular epidemiology is part of the antibiotic surveillance control as recommended by the World Health Organization; as it represents the future of the surveillance of resistance.